-DNA | 知乎問答精選


 



第四代測序(納米孔測序)有望全面代替邊合成邊測序嗎?

【調和級數的回答(13票)】: 個人覺得不會。 目前納米孔究竟算三代還是四代,說法尚不統一。下面對此不加以區分。 二代測序如此成熟的今天,一代測序也沒有消失。你要是構個載體,直接18塊錢做Sanger測序,24小時拿到結果,何必做二代測序燒錢? 同樣,如果三代或四代測序成熟了,只會造成測序市場的進一步細分,而不是完全取代二代測序的地位。 至於市場將會如何細分,因為三、四代畢竟尚未成熟...



基因測序技術出現後是不是老的生物分類有很多都被推翻了?

【趙俊義的回答(310票)】: 確實有很多都被推翻了。 很多進化關鍵點對應的物種被推翻了,比如說誰是最早出現的多細胞動物? 從形態學上,人們一直認為海綿動物(無中胚層,不對稱,無組織分化)是最早出現的多細胞動物。但測序結果卻證實,櫛水母(和水母在形態上非常類似,有中胚層,輻射對稱,有神經系統及肌肉系統的分化)才是最古老的多細胞生物,參見有哪些生物外形相似,但實際上分別屬於...



能簡單說說測序儀是什麼原理嗎?

【jamesr的回答(2票)】: Sanger測序可以看成擴增長度隨機的PCR反應+毛細管電泳 【XiYang的回答(2票)】: 蟹妖。 最日常的Sanger測序是基於類似PCR的反應的,反應體系裡加入一定比例的雙脫氧並帶螢光的ddNTP。反應使用單向引物,從同一個位置起始,如果一個分子在這一步加上的是ddNTP,那它就不會繼續延伸了。這樣產生的一系列不同長度的產物,都帶有停止反應那個位置的鹼基所對應的螢光標記。然後產物拉個單...



人類自然產生的奇美拉(chimera,又譯「嵌合體」)事件是怎麼回事?又如何影響到子女的 DNA?

美國發生過這樣的案例,在DNA的檢測中發現,生母和親生子女之間的DNA不匹配(三個兒子,其中兩個不匹配),原因是因為生母在母體中孕育的時候,胚胎顯示為一對兒雙胞胎,可是胚胎在成長的過程中,雙胞胎變成了單個胚胎,因此導致這個「奇美拉式的母親」生下的孩子,遺傳了他人的DNA。 到這裡就開始讓人迷惑了: 究竟是因此誕下的嬰兒身上同時具有胚胎中兩個人的DNA?還是孕育過程中一個人的DNA「吃掉」了...



基因測序在美國和中國都有哪些商業模式?

【YangHuang的回答(5票)】: 先說說美國的基因測序相關公司的現狀。準備簡單說說三大類靠基因測序賺錢的公司(基因測序設備,基因測序相關軟件和基因測序服務),每一類的代表公司,經營或是融資狀況。最後討論一下基因測序的前景。 介紹 狹義的說,基因測序就是決定一段基因中AGCT四類脫氧核糖核酸的順序,廣義的說,它還可能指基因組測序(genome sequencing)。,基因分型(genotyping),單核甘酸多態性...



毛毛蟲體內的第二組基因是怎樣激活,從而變成蝴蝶的?

人與自然中說昆蟲體內有兩組基因,第一種發育成毛毛蟲狀態,第二種發育成蝴蝶狀態。 【無水無雲的回答(128票)】: 題主是對的,幼蟲和成蟲的性狀當然是由不同的基因編碼的。 同一段DNA序列以不同的機制被表達,得到不同的表的產物,這是有的。比如兩個不同的基因可以存在於同一段雙螺旋的不同鏈之中;兩個不同的基因可能會有重疊之處;DNA在轉錄過程中,RNA合成酶可能忽然退後一段距離,接著重新讀取密碼子...



什麼是 DNA 甲基化?

【夏小拼的回答(94票)】: 正好在總結這方面的東西,借此機會給大家分享一下甲基化相關的知識。 之前曾經看到過幾個關於甲基化的問題,但是沒有人能夠系統地對這類問題進行回答。本文目的在於向對此領域有興趣的同學們進行簡單的科普。 我會時不時地更新(今後在更新的時候可能也會對之前發佈的內容進行修改),對此問題感興趣的童鞋可以關注這個問題,歡迎隨時和我討論!有不完善和錯誤的地方,歡迎指出和...



如何評價華大推出的Revolocity測序儀?

【夜神K2的回答(31票)】: 1. 測序原理依然是CG一直用的Sequencing by ligation (SBL) 而非illumina家明顯佔優勢的Sequencing by synthesis (SBS)。 雖然CG在前一段時間買了SBS的專利,但在這款測序儀上明顯沒有使用。28bp的讀長應該是4個7mer連起來的長度。 2. 讀長是28bp。50x coverage一個WGS,每年10000個WGS,一個run跑8天來算的話,一個run的通量大概是32.8T,就數據量講,絕對是測序儀中航母的體量的...



DNA鏈末端是什麼結構使其保持螺旋化?

或者說,是什麼結構使得DNA保持了螺旋狀?這個結構是如何起作用的? 【張旭的回答(7票)】: DNA的螺旋結構不是依靠鏈的末端來維持的。我們中學都學過經典的Watson-Crick配對,不同的鹼基之間是靠氫鍵相互識別並在空間上對應,因此兩條DNA單鏈之間的氫鍵是維繫其經典的雙螺旋結構的關鍵。 當然,還要解釋為啥它形成的是雙螺旋結構,而非其他結構。天然的DNA基本都是雙螺旋結構,從構型上說還有A,B,C,D,Z等不...



基因測序發展趨勢是什麼樣子?

【TangBoyun的回答(7票)】: 我覺得要好好討論這個話題得細分具體應用,以下是我個人的一些推斷: 基因組測序 這塊未來應該會以第三代測序等長讀長測序方法壟斷。長讀長可以大大降低基因組拼接的難度。無論是微生物組,還是複雜基因組(多倍體、多重複區),三代已優勢盡顯。 表觀遺傳測序 這塊得細分,DNA甲基化,三代方法可以直接測得修飾鹼基,因此有優勢。轉錄因子大部分為窄峰,二代比較適合。而RNA Po...


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